Determination of serum hepatitis B virus DNA in HBV endemic region: Clinical significance and correlation with serological markers, ALT and AST (HBV endemik bölgede serum HBV DNA düzeylerinin klinik önemi ve serolojik işaretler, ALT, AST ile ilişkisi)
Journal Title: Turk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi - Year 2016, Vol 73, Issue 3
Abstract
Objective: The aim of this study is to investigate, demographics and the relationship between serologic markers, liver enzymes and HBV DNA levels from the patients whose samples were sent to microbiology laboratory for HBV DNA polymerase chain reaction (PCR) test, in one of the greatest cities of Southeast Anatolia, where HBV infection is extremely common. Method: Between October 2009 and October 2010, blood samples of 1662 patients were sent to our laboratory for HBV DNA PCR testing as part of a routine examination for viral hepatitis in Şanlıurfa Training and Research Hospital in Turkey. Hepatitis markers (HBsAg, HBeAg, anti-HBs, anti-HBc IgM) and liver function enzymes (ALT, AST) are tested simultaneously in these samples. HBsAg, HBeAg, anti-HBs and anti- HBc IgM levels were assessed with chemiluminescent microparticle immunoassay method (Architect-i2000 SR, Abbott, Ireland). ALT and AST levels were measured with commercial kits in Roche Modular-P and Roche- Integra autoanalysator (Roche Diagnostics Mannheim, Germany). HBV DNA PCR: Isolation of HBV DNA from serum samples was done with M24sp automated extraction device (Abbott, USA). Purified DNA was amplified with Real-Time PCR method with the help of Abbott-m2000 sample preparation system (Abbott, USA). Results: The mean age was 33.7 (Min-Max: 0-89) years old and the majority of the patients were male (Male/Female: 1103/559) in the study. HBsAg was positive in 96.2% of the patients and the median ALT level of these patients were 94 u/l (Min-Max: 4-2390 u/l), while median AST level was 74 u/l (Min-Max: 7-2505 u/l). HBV DNA was positive in 94.6% of HBsAg positive patients and the median HBV DNA level was 3.9x104 copies/ml (Min-Max: 35-3.4x109 copies/ml). HBeAg was positive in 17.1% of HBsAg positive patients. Median levels of ALT and AST in HBsAg negative patients (3.8%) were 32 u/l (Min-Max: 7-497 u/l) and 33 u/l (Min- Max: 13-280 u/l) respectively. HBV DNA was positive in only 7.9% of the patients with median HBV DNA level of 155 copies/ml (Min-Max: 34-624 copies/ml). HBeAg was found negative in 71.4% of patients with negative HBsAg and positive HBV DNA. In 26 of 1662 patients (1.6%), both HBsAg and Anti-HBs were negative (N/N). Only two of the N/N patients (7.7%) were found anti-HBc positive. Mean ALT and AST levels of two anti-HBc positive patients were 29.5 u/l and 30.5 u/l, respectively. HBV DNA was negative in one of these patients, and the other was found positive with a level of 3×102 copies/ml. Conclusion: To acquire more reliable results on the diagnosis and follow-up of the treatment of Hepatitis B, quantitative HBV DNA tests should be used in together with more frequently used serologic and biochemical methods. Amaç: Bu çalışmanın amacı, HBV infeksiyonunun son derece yaygın olduğu Güneydoğu bölgesindeki büyük şehirlerden birinde HBV DNA polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) testi için mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen hasta örneklerinde, demografik özellikler ve serolojik belirteçler, karaciğer enzimleri ve HBV DNA seviyeleri arasındaki ilişkileri incelemektir. Yöntem: Ekim 2009-Ekim 2010 tarihleri arasında Şanlıurfa Eğitim ve Araştırma Hastanesinde viral hepatitin rutin testlerinin bir parçası olan HBV DNA PCR testi için 1662 hastanın kan örneği laboratuvarımıza gönderildi. Bu örneklerde eş zamanlı olarak hepatit belirteçleri (HBsAg, HBeAg, anti-HBs ve anti-HBc IgM) ve karaciğer fonksiyon enzimleri (ALT, AST) çalışıldı.HBsAg, HBeAg, anti-HBs ve anti- HBc IgM seviyeleri kemiluminesan mikropartikül immunoassay yöntemi ile (Architect i2000 SR, Abbott, Ireland) çalışıldı. ALT ve AST seviyeleri Roche Modular P ve Roche Integra otoanalizörde (Roche Diagnostics Mannheim, Germany) ticari kitler ile ölçüldü. HBV DNA PCR: Serum örneklerinde HBV DNA’nın izolasyonu M24sp otomatize ekstraksiyon cihazı (Abbott, USA) ile yapıldı. Saflaştırılmış DNA Abbott m2000 sample preparation system (Abbott, USA) yardımı ile ve Real- Time PCR yöntemi ile DNA amplifikasyonu yapıldı. Bulgular: Çalışmamızda ortalama yaş 33,7 (Min-Maks: 0-89) ve örneklerin çoğunluğu erkek cinsiyettedir (Erkek/Kadın: 1103/559). Hastaların %96.2’sinin HBsAg’si pozitifti ve bu hastaların ortanca ALT seviyesi 94 u/l (Min-Maks: 4-2390 u/l) iken, ortanca AST seviyesi 74 u/l (Min-Maks: 7-2505 u/l)’dir. HBsAg pozitif hastaların %94.6’sında HBV DNA pozitif ve ortanca HBV DNA düzeyi 3.9x104 kopya/ml (Min-Maks: 35-3.4x109 kopya/ml)’dir. HBsAg pozitif hastaların %17.1’inde HBeAg pozitif idi. HBsAg negatif hastaların (%3.8) ortalanca ALT ve AST düzeyleri sırasıyla 32 u/l (Min-Maks: 7-497 u/l) ve 33 u/l (Min- Maks: 13-280 u/l)’dir. HBV DNA hastaların sadece %7.9’unda pozitifti ve ortanca HBV DNA seviyesi 155 kopya/ml (Min-Maks: 34-624 kopya/ml) idi. HBsAg negatif ve HBV DNA pozitif hastaların %71.4’ünde HBeAg negatif bulundu. 1662 hastanın 26 (%1.6)’sında HBsAg ve Anti-HBs’ nin her ikisi de negatif (N/N) idi. Bu N/N hastalarının sadece ikisi (%7.7) anti-HBc pozitif bulundu. İki anti-HBc pozitif hastanın ortalama ALT ve AST seviyeleri sırasıyla 29.5 u/l ve 30.5 u/l idi. Bu hastaların birinin HBV DNA’sı negatif idi ve diğeri 3×102 kopya/ml ile pozitif bulundu. Sonuç: Hepatit B infeksiyonlarının tanısında ve tedavisinin takibinde daha güvenilir sonuçlar elde edebilmek için daha sık kullanılan serolojik ve biyokimyasal testler ile birlikte kantitatif HBV DNA testleri kullanılmalıdır.
Authors and Affiliations
Tuba MUDERRİS, Osman Sezer CİRİT, Tulin YAZICI
Antibiyotik kullanımı ve obezite arasındaki köprü: Mikrobiyota mı? (The bridge between antibiotic use and obesity: Is it a microbiota?)
ÖZET Hemostazın sağlanması ve hastalıkların gelişmesinde belirgin etkisi olan bağırsak mikrobiyotası insan gastrointestinal sisteminde yaşayan kompleks ve dinamik bir mikroorganizma topluluğundan oluşmaktadır. Bağırsak b...
2017 yılı içerisinde meydana gelen kadın cinayetlerinin haber kaynakları üzerinden kişi, yer ve zaman özelliklerine göre tanımlanması (The definition of the person, place and time characteristics of women homicides from news sources in 2017)
Amaç: Araştırmamızda 2017 yılı içinde meydana gelmiş kadın cinayetlerinin; kişi, yer ve zaman özelliklerinin tanımlanması ve kadına yönelik şiddete dikkat çekmek amaçlanmıştır. Yöntem: Araştırma tanımlayıcı türdedir. Ar...
Aksaray, Nevşehir ve Niğde illerindeki ilçe okullarında Stafilokokal enterotoksin ve Bacillus cereus ilişkili gıda kaynaklı salgın, 2015 (Food-borne outbreak associated with Staphylococcal enterotoxin and Bacillus cereus in districts schools—Aksaray, Nevsehir and Nigde provinces, 2015)
Amaç: Aynı yemek firmasında 25 Mayıs 2015’te hazırlanan öğle yemeğinden yeyen 7 ilçeden 872 öğrenci hastanelere bavurmuştur. Hastaneye başvuranların 406’sında bulantı, kusma, baş dönmesi ve titreme şikayetleri olduğu bel...
Adana ilindeki bazı çiftçilerin genetiği değiştirilmiş tohumlar hakkındaki bilgi düzeyleri ve tutumları (Knowledge and attitudes of some farmers about genetically modified seeds in Adana province)
Amaç: Genetiği Değiştirilmiş (GD) ürünler son yıllarda hem dünyada, hem de Türkiye’de çeşitli tartışmaları ve uyuşmazlıkları içinde barındıran bir konudur. Günümüzde GD ürünlerin üretimi ve kullanımı yıldan yıla artış gö...
Investigation of three different methods for detection of ESBL production and antibiotic resistance percentage of ESBL producing Gram negative bacteria (Gram negatif bakterilerde GSBL üretiminin üç farklı yöntemle araştırılması ve antibiyotik direnç oranları)
ABSTRACT Objective: In this study, it was aimed to evaluate the efficacy of chromogenic agar for rapid and accurate identification of bacteria producing extended spectrum beta-lactamase (ESBL) and to investigate the anti...