Identyfikacja profilu ekspresji genów związanego z opornością ex vivo na etopozyd w dziecięcych ostrych białaczkach
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2012, Vol 66, Issue 0
Abstract
Wstęp: Oporność na terapię oraz związany z nią profil ekspresji genów dyskryminują wyniki leczenia, a także wskazują podgrupy pacjentów z niekorzystnym rokowaniem. Celem badań była analiza profilu ekspresji genów w korelacji z profilem chemiooporności ex vivo na etopozyd u dzieci z ostrymi białaczkami. Materiał/Metody: Profil oporności ex vivo oznaczono w teście cytotoksyczności MTT na komórkach białaczkowych pobranych od 56 pacjentów. Profil ekspresji genów opracowano na podstawie wyników hybrydyzacji cRNA do macierzy oligonukleotydowych HGU133A 2.0 Chip. Do zidentyfikowanego zestawu sond przeprowadzono analizę korelacji, grupowanie hierarchiczne, przypisanie lokalizacji i funkcji. Weryfikację danych o poziomie ekspresji dla 4 wybranych genów (MNDA, GH1, NUDT21, RHOG) przeprowadzono techniką QPCR w badanej oraz niezależnej grupie 54 pacjentów. Wyniki: Za pomocą permutacyjnego testu korelacji Spearmana wyselekcjonowano zestaw 233 sond/209 genów. Ekspozycja blastów białaczkowych na etopozyd inicjuje złożoną odpowiedź komórkową, będącą odzwierciedleniem globalnych zmian ekspresji genów. Globalny test istotności różnic potwierdził (p<0,001) związek profilu ekspresji genów z opornością na etopozyd. Gen NUDT21 (Nudix, nucleoside diphosphate linked moiety X-type, motif 21) wykazywał najsilniejszą korelację z opornością na etopozyd (FDR<0,0001%). Podsumowanie: Profilowanie ekspresji genów może pomóc w ocenie wrażliwości na leki stosowane w chemioterapii dużymi dawkami. Oporność na etopozyd prawdopodobnie jest związana ze znaczną liczbą biologicznie ważnych genów i jest konsekwencją współistnienia w komórce nowotworowej różnych mechanizmów.
Authors and Affiliations
Joanna Szczepanek, Jan Styczyński, Andrzej Tretyn, Monika Pogorzała, Mariusz Wysocki
Keywords
Related Articles
- EP ID EP66716
- DOI -
- Views 166
- Downloads 0
Prozdrowotne właściwości pektyn
Pektyny to heteropolisacharydy pozyskiwane na skalę przemysłową z roślinnych ścian komórkowych, wykorzystywane powszechnie jako czynnik żelujący w produkcji dżemów i galaretek oraz jako stabilizator napojów mlecznych i o...
The importance of putrescine in the human body
Putrescyna odgrywa znaczącą rolę w regulacji podziału, różnicowania i dojrzewania komórek oraz procesu apoptozy. Jako związek polikationowy stabilizuje strukturę DNA i uczestniczy w funkcjonowaniu błon komórkowych. Może...
The role of selected mediators of inflammation in the pathogenesis of cancer
The role of the immune system, consisting of many different types of cells and proteins, is to recognize and/or reaction to “foreign material”. Disorders of the immune system, among others may lead to inflammatory diseas...
Inhibitory kinazy tyrozynowej w rozrostowych chorobach układu krwiotwórczego
W ostatnich latach nowe strategie leczenia nowotworów opierają się głównie na terapii celowanej. Kinazy tyrozynowe ze względu na to, iż przenoszą reszty fosforanowe z adenozynotrifosforanu (ATP) na tyrozynę uczestnicząc...
Genetic factors in pathogenesis, course and treatment of inflammatory bowel diseases
Inflammatory bowel diseases (IBD) are a group of chronic gastrointestinal disorders with alternating relapses and remissions. Two main types within IBD can be distinguished: Crohn’s disease and ulcerative colitis. Consid...