İmmün sistemi baskılı hastaların klinik örneklerinden soyutlanan Candida türlerinin PCR ile belirlenmesi ve antifungal direnç genlerinin RFLP ve sekans analizi ile saptanması
Journal Title: Dicle Tıp Dergisi - Year 2012, Vol 39, Issue 2
Abstract
Amaç: Bu çalışmanın amacı immun sistemi baskılı hastalardan elde edilen klinik örneklerden izole edilen Candida türlerinde PCR tekniğinin ve RFLP ve sekans analizi ile antifungal direnç genlerinin araştırılmasıdır. Gereç ve yöntem: Çalışmada immün sistemi baskılı 200 hastadan alınan klinik örnekler (96 bronkoalveoler lavaj, 56 biyopsi-apse, 8 kan, 15 periton diyaliz sıvısı, 15 plevra sıvısı, 5 beyin omurilik ve 5 perikard sıvısı) geleneksel ve moleküler yöntemler ile incelenmiş ve sonuçlar değerlendirilmiştir. Örneklerden mantar DNA’sı saptandıktan sonra elde edilen ürünün, multipleks PCR yardımı ile tür düzeyinde tanısı yapılmış, antifungal direnci E-test, direnç genleri ise RFLP analizi ile saptanmıştır. Bulgular: İkiyüz örneğin 30’unda (%15) kültür yöntemleri ile pozitif sonuç alınmış [20 Candida albicans (%67), beş Candida parapsilosis (%17), beş Candida tropicalis (%17)], 170 (%85) örnekte üreme olmamıştır. Genel primerler ile yapılan PCR testi sonucunda kültürleri olumlu bulunan 30 örneğin tümünün mantar DNA’sı içerdiği belirlenmiştir. İzole edilen suşların biri E-test yöntemiyle flukanozole dirençli, ikisi flukanozole doza bağlı duyarlı olarak saptanırken 27’si duyarlı olarak bulunmuştur. Seçilen uygun primerler ile BamHI ve SalI enzimleri kullanılarak RFLP uygulanmış, yapılan analizler sonucunda dirençli bir C.albicans suşunda 600 bp’lik bant görülmüştür. Candida dubliniensis (950 bp) ve Candida krusei (360 bp) ile yapılan multipleks PCR optimizasyonunda başarı sağlanmıştır. Suşların ERG genine uygun primer çiftleri ile PCR’ları yapıldıktan sonra yapılan sekans analizi sonucunda dirençli C.albicans suşu referans gen ile karşılaştırıldığında D132E, E216D mutasyonları belirlenmiştir. Sonuç: Moleküler test yöntemleri özellikle immün sistemi baskılanmış hasta populasyonunun kısa sürede doğru tedavisine olanak sağladıkları için yaşamsal açıdan önemlidir.
Authors and Affiliations
Serdar Susever, Yıldız Yeğenoğlu
Keywords
Related Articles
- EP ID EP135225
- DOI -
- Views 135
- Downloads 0
Left sided Amyand Hernia: A very rare case
An inguinal hernia containing appendix is termed an Amyand's hernia. It is a rare condition estimated to be found in approximately 1 % of all inguinal hernia repairs. Depending on the presence of inflammation in the her...
Comparison of four different surgical techniques in cases with pilonidal sinus
Objective: The aim of this study is to compare the results of four different surgical techniques used for pilonidal sinus. Methods: A total of 339 patients who underwent surgery for pilonidal sinus between Januray 2000...
Blastocystis ’in moleküler epidemiyolojisi
Blastocystis patojenitesi ve sınıflandırması moleküler genetik çalışmalarla yeni aydınlatılmış ve son zamanlarda birçok araştırmacının ilgi odağında bulunan bir parazittir. Blastocystis’in genotiplendirilmesinde polimer...
The effects of internet use intensity on quality of life, anxiety and depression scores in pediatric migraine
Objective: We aim to compare the quality of life, anxiety and depression scores of schoolchildren and adolescent migraineurs with healthy subjects according to the intensity of their Internet use. Methods: The migrai...
Simultaneous bilateral tibal tubercle avulsion: A rare fracture
Tibial tuberosity avulsion is a rare fracture in adolescence. Due to the shear forces on the immature epiphysis. Thirteen years old girl was admitted to the emergency department with knee pain and tenderness in bot...