İmmün sistemi baskılı hastaların klinik örneklerinden soyutlanan Candida türlerinin PCR ile belirlenmesi ve antifungal direnç genlerinin RFLP ve sekans analizi ile saptanması
Journal Title: Dicle Tıp Dergisi - Year 2012, Vol 39, Issue 2
Abstract
Amaç: Bu çalışmanın amacı immun sistemi baskılı hastalardan elde edilen klinik örneklerden izole edilen Candida türlerinde PCR tekniğinin ve RFLP ve sekans analizi ile antifungal direnç genlerinin araştırılmasıdır. Gereç ve yöntem: Çalışmada immün sistemi baskılı 200 hastadan alınan klinik örnekler (96 bronkoalveoler lavaj, 56 biyopsi-apse, 8 kan, 15 periton diyaliz sıvısı, 15 plevra sıvısı, 5 beyin omurilik ve 5 perikard sıvısı) geleneksel ve moleküler yöntemler ile incelenmiş ve sonuçlar değerlendirilmiştir. Örneklerden mantar DNA’sı saptandıktan sonra elde edilen ürünün, multipleks PCR yardımı ile tür düzeyinde tanısı yapılmış, antifungal direnci E-test, direnç genleri ise RFLP analizi ile saptanmıştır. Bulgular: İkiyüz örneğin 30’unda (%15) kültür yöntemleri ile pozitif sonuç alınmış [20 Candida albicans (%67), beş Candida parapsilosis (%17), beş Candida tropicalis (%17)], 170 (%85) örnekte üreme olmamıştır. Genel primerler ile yapılan PCR testi sonucunda kültürleri olumlu bulunan 30 örneğin tümünün mantar DNA’sı içerdiği belirlenmiştir. İzole edilen suşların biri E-test yöntemiyle flukanozole dirençli, ikisi flukanozole doza bağlı duyarlı olarak saptanırken 27’si duyarlı olarak bulunmuştur. Seçilen uygun primerler ile BamHI ve SalI enzimleri kullanılarak RFLP uygulanmış, yapılan analizler sonucunda dirençli bir C.albicans suşunda 600 bp’lik bant görülmüştür. Candida dubliniensis (950 bp) ve Candida krusei (360 bp) ile yapılan multipleks PCR optimizasyonunda başarı sağlanmıştır. Suşların ERG genine uygun primer çiftleri ile PCR’ları yapıldıktan sonra yapılan sekans analizi sonucunda dirençli C.albicans suşu referans gen ile karşılaştırıldığında D132E, E216D mutasyonları belirlenmiştir. Sonuç: Moleküler test yöntemleri özellikle immün sistemi baskılanmış hasta populasyonunun kısa sürede doğru tedavisine olanak sağladıkları için yaşamsal açıdan önemlidir.
Authors and Affiliations
Serdar Susever, Yıldız Yeğenoğlu
Keywords
Related Articles
- EP ID EP135225
- DOI -
- Views 139
- Downloads 0
Value of a new inflammatory parameter in malignant pleural mesothelioma prognosis
Objective: Malignant Pleural Mesothelioma (MPM) generally associated with asbestos exposure is a tumor with poor prognosis. Modified Glasgow Prognostic Score (GPS) which may be a prognostic parameter in patient...
Lateral sinus thrombosis patient presenting with headache and vomiting
Lateral sinus thrombosis is rare intracranial complications of otitis media. A 12 years old girl patient presented with complaints of vomiting and headeche. Patient treated with ceftriaxone had lost seven kilograms in...
Doğu Anadolu’da yeni açılan bir üniversitenin öğrencilerinde kaygı düzeylerinin sağlık, sosyal ve demografik faktörler ile ilişkisi
Amaç: Bu çalışma Tunceli Üniversitesi öğrencilerinde var olabilecek kaygı düzeylerini ve ilişkili faktörleri belirleyebilmek amacıyla yapılmıştır. Gereç ve yöntem: Tanımlayıcı tipte olan bu araştırma Tunceli Üniversi...
Nadir görülen bir olguda zor havayolu yönetimi: Singnati
Konjenital izole mandibula ve maksilla füzyonu nadir görülen fakat neonatal dönemde havayolunun sağlanmasında anesteziste önemli zorluklar çıkarabilen bir anomalidir. Havayolunun korunması ve intraoperatif yönetimi zor...
Radical Prostatectomy In High-Risk Prostate Cancer
Objective: There are some treatment choices such as surgery and radiotherapy in the treatment of high-risk prostate cancer. Today, some centers prefer surgical procedures in high-risk group due to increasing surgical e...