Молекулярна організація 5S рДНК двох українських популяцій явора (Acer pseudoplatanus)
Journal Title: Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів - Year 2016, Vol 14, Issue 2
Abstract
Мета. Генетична мінливість деревних порід все ще залишається мало дослідженою на молекулярному рівні. З огляду на порівняно низьку швидкість молекулярної еволюції у деревних багаторічних видів, для вивчення їх внутрішньовидового різноманіття слід обирати лише ті ділянки геному, які демонструють найвищу мінливість, напр., 5S рДНК. Відповідно, для оцінки потенціалу 5S рДНК в якості молекулярного маркера у деревних порід, було порівняно організацію цієї ділянки у представників двох географічно віддалених українських популяцій явора Acer pseudoplatanus. Методи. ПЛР-ампліфікація, клонування та розшифрування нуклеотидної послідовності МГС 5S рДНК A. pseudoplatanus. Результати. Встановлено, що у геномі A. pseudoplatanus присутній лише один клас повторів 5S рДНК довжиною 475 нп. Потенційні зовнішні елементи промотора РНК-полімерази ІІІ, які локалізуються у МГС, відрізняються від описаних у літературі для представників інших родин покритонасінних рослин. Рівень внутрішньогеномної подібності повторів 5S рДНК перевищує 99%, тоді як подібність МГС індивідуумів, які належать до різних популяцій явора становить лише 93,9-94,3%. Висновки. Висока швидкість молекулярної еволюції МГС 5S рДНК дозволяє використовувати порівняння цієї ділянки для оцінки генетичного різноманіття у популяціях A. pseudoplatanus.Ключові слова: 5S рДНК, молекулярна еволюція, внутрішньовидова мінливість, Acer.
Authors and Affiliations
O. O. Rusak, V. I. Petrashchuk, I. I. Panchuk, R. A. Volkov
Keywords
Related Articles
- EP ID EP613745
- DOI 10.7124/visnyk.utgis.14.2.691
- Views 82
- Downloads 0
Gennadiy Dmitrovych Berdyshev (07.11.1930-14.02.2016)
Strengthening Cooperation in Molecular Biomedicine between EU and Ukraine: the COMBIOM experience
Взаимодействие верпролина WIRE с семейством адаптерных белков интерсектинов
Цель. WIRE — скафолдный белок, который регулирует перестройки актинового цитоскелета и образование актин обогащённых мембранных выростов, ответственных за инвазию и миграцию. ITSN1 и ITSN2 представители семейства интерсе...
Оцінка генетичноЇ різноманітності різних видів деревних рослин за допомогою поліморфізму інтронів генів β-тубуліну
Мета. Проаналізувати ефективність застосування методу аналізу поліморфізму довжини інтронів генів β-тубуліну (ТВР-метод) для оцінки генетичного різноманіття видів деревних рослин шляхом апробації метода на широкій вибірц...
Polymorphism in the short arm of 1R rye chromosomes in wheat lines with 1RS.1BL translocation and 1R(1B) substitution from different sources
Aim. The short arm of 1R rye (Secale cereale L.) chromosome is widely used in the breeding of bread wheat (Triticum aestivum L.), in particular 1RS.1BL, to introsgress genes of resistance to leaf (Lr26), stem (Sr31), str...