Nucleotide sequences of tRNA-methonine genes of Streptomyces globisporus 1912-2, identified in silico

Abstract

Aim of this work was to identify nucleotide sequences of tRNAMet of S. globisporus 1912-2. Methods. Resources of server NCBI (programs BLAST: blast, discontiguous megablast and databases: “Genome”, “Nucleotide”) were used for in silico analysis of library of S. grlobisporus 1912-2 contigs. Results. Nucleotide sequences of 4 genes of tRNAMet of S. globisporus 1912-2 were determined in silico. Molecules of tRNA of the II type were translated from tRNAMet gene (Contig № 21 (936–1008 bp)) and the molecules of tRNAfMet genes (Contigs № 299 (1713–1787 bp), № 255 (5941–6015 bp)). Conclusions. 4 genes of transfer RNAs-methionine were identified in silico in S. globisporus 1912-2 genome. Two genes from them coded tRNAfMet molecules. The nucleotide sequences of all tRNAMet genes were identified.Keywords: gene, tRNA, methionine, nucleotide sequence, Streptomyces.

Authors and Affiliations

L. V. Polishchuk

Keywords

Related Articles

Проблеми еволюції, доместикації, генетики, селекції і біотехнології у тваринництві

У статті подано інформацію про Міжнародну наукову і навчальну конференцію «Проблеми еволюції, доместикації, генетики, селекції і біотехнології у тваринництві», присвячену 130-річчю від дня народження видатного вченого ге...

Роль жасмонатного сигнального шляху у відповіді генів цвітіння на іонізуюче опромінення

Мета. Метою даного дослідження є вивчення ролі жасмонатного сигналінгу у регуляції генів цвітіння рослин під впливом іонізуючого випромінювання. Матеріали і методи. Для проведення експерименту ми використовували рослини...

All-Ukrainian scientific and practical conference with international participation «Ternopil Biological Readings — Ternopil Bioscience — 2017, dedicated to the 20th anniversary of the establishment Ukrainian scientific journal «Scientific Proceedings of

The article presents information about the All-Ukrainian Scientific and Practical Conference with International Participation «Ternopil Biological Readings — Ternopil Bioscience — 2017, dedicated to the 20th anniversary...

Determination of the united quality latent index of adaptability (UQLIA) and contribution of some environmental parameters to it for Deschampsia antarctica populations, Galindez island (Maritime Antarctic) season 2017/2018

The purpose of our work has been to determine the indicator of complex adaptability — the United Quality Latent Index of Adaptability (UQLIA) for the experimental populations of Deschampsia antarctica É. Desv. and study...

Download PDF file
  • EP ID EP613449
  • DOI 10.7124/visnyk.utgis.14.1.545
  • Views 92
  • Downloads 0

How To Cite

L. V. Polishchuk (2016). Nucleotide sequences of tRNA-methonine genes of Streptomyces globisporus 1912-2, identified in silico. Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів, 14(1), 58-62. https://www.europub.co.uk/articles/-A-613449