Ocena przydatności metody multiplex PCR do identyfikacji i różnicowania drobnoustrojów z grupy Bacillus cereus
Journal Title: Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia - Year 2012, Vol 64, Issue 2
Abstract
Introduction: Bacillus genus comprises about 215 species. The most closely related are B. cereus, B. thuringiensis, B. anthracis, B. mycoides, B. pseudomycoides and B. weihenstephanensis. These bacterial species belong to the Bacillus cereus group. Identification and differentiation of Bacillus cereus group bacteria is difficult because of genetic and phenotypic similarity. Many molecular methods have already been suggested to differentiate B. cereus group members. However easier and more convenient methods are still sought. The aim of this study was to evaluate of multiplex PCR method to identify and distinguish strains of Bacillus cereus group, as proposed by Park et al. (J Microbiol Biotechnol 2007; 17: 1177-82).Materials and method: Twenty four strains of Bacillus cereus group included B. cereus, B. anthracis, B. thuringiensis and B. weihestephanensis was examined. A multiplex-PCR assay for the differentiation of the species has been applied by using three pairs specific oligonucleotide primers based on sequences of gyrB genes which identify species from Bacillus cereus group and one pair specific primers based on sequences of groEL gene, which are used to identify Bacillus cereus group.Results: Using a specific primers complementary to fragment of groEL gene, we received all PCR products and thus we identified Bacillus cereus group. We have not recived a specific products characteristic for each of the species. Oligonucleotide primers recognizedby Park et al. as specific for each species were complementary (often 100%) for the gyrB gene sequence in almost all species of the B. cereus group. Conclusions: The multiplex PCR method proposed by Park et al. multiplex PCR method for identification of B. cereus group and individual bacterial species has been proved to be useful only for identification the entire group of B. cereus. This method does not provide specific identification of the individual species. Lack of specificity of the primers used in this study creates a risk of obtaining PCR product in more than one species of the entire examined group of bacteria and does not allow the precise identification to the species level. Oceniono przydatność metody multiplex PCR opisanej przez Park i wsp.(J Microbiol Biotechnol 2007; 17: 1177-82) do identyfikacji i różnicowania drobnoustrojów z grupy Bacillus cereus. Stwierdzono przydatność metody do potwierdzenia przynależności badanego szczepu do tej grupy. Nie potwierdzono natomiast swoistości oligonukleotydów starterowych użytych w celu identyfikacji poszczególnych gatunków wchodzących w skład grupy B. cereus.
Authors and Affiliations
Kamila Formińska, Aleksandra Anna Zasada, Marek Jagielski
Keywords
Related Articles
- EP ID EP75329
- DOI -
- Views 148
- Downloads 0
Wpływ stymulacji wirusem odry na ekspresję receptorów Toll-like w komórkach PBMC Measles virus stimulation effect on the expression of Toll-like receptors in PBMC
W pracy opisano wpływ stymulacji wirusem odry komórek PBMC izolowanych od zdrowych osób szczepionych przeciwko odrze (seropozytywnych i seronegatywnych), na ekspresję receptorów Toll-like. Oceniano ekspresje receptorów T...
Pokrewieństwo meticylinoopornych szczepów gronkowców koagulazo-ujemnych
Przeprowadzono analizę pokrewieństwa 46 meticylinoopornych szczepów Staphylococcus epidermidis w oparciu o wzory chromosomalnego DNA uzyskane techniką elektroforezy w zmiennym polu elektrycznym. Wykazano zbieżność wynikó...
Identyfikacja Francisella tularensis techniką real - time PCR z wykorzystaniem sond hybrydyzujących zaprojektowanych dla fragmentów sekwencji genów fopA i tul4
Badano przydatność zaprojektowanych starterów FopA F/R, Tul4 F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2, Tul4 S1/S2 dla genów fopA i tul4 do wykrywania F. tularensis. W badaniach, w których użyto 50 szczepów F. tularensis uzy...
Wpływ wielokrotnego, cyklicznego zamrażania i rozmrażania próbki surowicy na poziom przeciwciał klasy IgA, IgG i IgM dla wybranych antygenów bakteryjnych
Introduction. In presented study we investigated the effect of multiple freeze-thaw cycles of human sera on the determination of IgA, IgG and IgM antibodies to selected bacterial antigens. Methods. A panel of 15 serum sa...
Wpływ warunków przechowywania materiału klinicznego na wynik wirusologicznych oznaczeń metodą RT-PCR
Określeno wpływ temperatury, czasu przechowywania próbek różnych materiałów klinicznych oraz liczby cykli zamrażania i rozmrażania na wyniki oznaczeń przeprowadzonych metodą RT-PCR. Badania przeprowadzono w modelu wirusa...