ПРОФІЛЮВАННЯ ГЕНОМУ СОРТІВ ЧЕРЕШНІ УКРАЇНСЬКОЇ СЕЛЕКЦІЇ ЗА ДОПОМОГОЮ IRAP-ПЛР ТА REMAP-ПЛР МАРКЕРІВ
Journal Title: Naukovyi visnyk Chernivetskoho universytetu. Biolohiia (Biolohichni systemy) - Year 2014, Vol 6, Issue 2
Abstract
Використання однорідного садивного матеріалу з підтвердженою генетичною ідентичністю – одна з головних вимог при створенні садів інтенсивного типу. Ефективність методу ідентифікації та аналізу генетичних відмінностей між різними сортами плодових культур за допомогою традиційних фенотипових ознак є недостатньою, оскільки значним чином залежить від впливу факторів зовнішнього середовища. Профілювання геномів з використанням молекулярно-генетичних маркерів є найбільш точним та надійним способом вивчення генетичного різноманіття еукаріотичних геномів. Використання ретротранспозонних генетичних маркерів є потужним засобом для генетичного профілювання еукаріотичних геномів, оскільки вони є найбільш численною групою мобільних елементів в геномі рослин та відіграють важливу роль в його реорганізації у відповідь на дію природного та штучного добору. Проблема пошуку найбільш інформативних маркерних систем для генетичного профілювання геномів сортів черешні є особливо актуальною з огляду на досить низький рівень генетичного поліморфізму у цієї культури. Це є відображенням обмеженої генетичної мінливості геноплазми сортів черешні внаслідок системи гаметофітної самонесумісності. В роботі досліджено 13 сортів черешні української селекції та два сорти закордонної селекції в якості контролю. Загальну геномну ДНК виділяли ЦTAБ-методом з деякими модифікаціями. ПЛР проводили методами IRAP та REMAP. Продукти ампліфікації розділяли в поліакриламідному гелі. Дискримінаційні можливості використаних маркерних систем оцінювали за допомогою різних показників поліморфізму для порівняння їх інформативності. Проведена робота дозволила оцінити дискримінаційні можливості та технічні особливості застосування декількох систем генетичного профілювання геномів сортів черешні української селекції з використанням IRAP- та REMAP-ПЛР маркерів та виявити серед них найбільш перспективні для рутинного аналізування. Використання п'яти праймерів (IRAP-ПЛР) та двох комбінацій праймерів (REMAP-ПЛР) дозволило в сумі отримати 63 маркери, з яких 23.8 % виявилося поліморфними. Було показано, що для генетичного профілювання сортів черешні перспективним є застосування комбінації праймерів TRIM K002 +8565 й окремих праймерів TRIM K002, iPBS 2272 та iPBS 2077.
Authors and Affiliations
Я. І. ІВАНОВИЧ, Н. В. ТРЯПІЦИНА
Keywords
Related Articles
- EP ID EP246021
- DOI -
- Views 167
- Downloads 0
СЕЗОННА ДИНАМІКА ВМІСТУ ВАЖКИХ МЕТАЛІВ У ВОДІ КОЛОДЯЗІВ НА ТЕРИТОРІЇ ПРИКАРПАТТЯ
Метою нашого дослідження був аналіз річної динаміки вмісту важких металів у питній воді Прикарпаття та порівнянні їх з нормативними показниками вмісту у природних водах. Об’єктом виступала вода з криниць даного регіону,...
Підсумки інтродукції представників родини Vitaceae lindl. у чернівецькій області
Проаналізовано сезонний ритм розвитку 13 видів та 1 форми дерев’янистих ліан родини Vitaceae Lindl. інтродукованої флори Чернівецької області, на основі чого здійснено їх розподіл на фенологічні групи за строками початку...
Акумуляція радіонуклідів у молоді та дорослих особин сріблястого карася (Carassius gibelio) запорізького водосховища
Досліджено процеси міграції та накопичення радіонуклідів у різновікових особин карася сріблястого (Carassius gibelio) в Запорізькому водосховищі – водоймі багатоцільового призначення. Водосховище розташоване в Дніпровськ...
АКТИВНІСТЬ ЛУЖНОЇ ФОСФАТАЗИ СЕСТОНУ НА ГІДРОФІЗИЧНОМУ ПОЛІГОНІ ТРОПІЧНОЇ ЗОНИ ТИХОГО ОКЕАНУ
Наведено результати визначення активності лужною фосфотази сестону поверхні вод північно-східної частини тропічної зони тихого океану. Результати даних досліджень необхідно для визначення екологічного фону на гідрофізичн...
Species of Orchidaceae Juss. in the National Natural Park "Vyzhnytsky": distribution, coenotical affiliation
Information on the distribution of 23 species of Orchidaceae family on the territory of the National Nature Park (NPP) "Vyzhnytsky" is provided. For each species it is given information about nature conservation status a...