Struktura chromosomu bakteryjnego – metody analizy oddziaływań białko-DNA in vivo
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2017, Vol 71, Issue
Abstract
Badania prowadzone w ostatnich latach ujawniły, że chromosom bakteryjny wykazuje hierarchiczną organizację. Liczne białka wiążące DNA kondensują chromosom lokalnie oraz zapewniają jego odpowiednie upakowanie w skali globalnej. Połączenie zaawansowanych technik biologii molekularnej oraz wysokoprzepustowych metod sekwencjonowania DNA pozwala na precyzyjną analizę struktury chromosomu bakteryjnego w skali lokalnej i globalnej. Przykładowo in vivo footprinting oraz ChIP-seq umożliwiają wyznaczenie miejsc wiązania analizowanych białek zarówno w określonym miejscu jak wzdłuż całego chromosomu. Natomiast techniki 3C pozwalają na analizę oddziaływań przestrzennych w skali globalnej. Wgląd w złożone struktury tworzone przez białka odpowiedzialne za organizację chromosomu bakteryjnego zapewniają techniki wysokorozdzielczej mikroskopii fluorescencyjnej.
Authors and Affiliations
Joanna Hołówka, Małgorzata Płachetka
Keywords
Related Articles
- EP ID EP242335
- DOI 10.5604/01.3001.0010.6696
- Views 167
- Downloads 0
Badanie potencjału przeciwwolnorodnikowego różnych rodzajów herbat oraz wyciągów uzyskanych z tych herbat za pomocą jednostki aktywności przeciwwolnorodnikowej (TAU)
Wprowadzenie: Herbata zielona, czarna i pu-erh mają, w porównaniu do innych surowców roślinnych, silne właściwości przeciwwolnorodnikowe. W pracy zbadano15 różnych herbat należących do trzech typów, zielonych, czarnych...
Pharmaceutical applications of graphene
Nowadays, dynamic development in nanotechnological sciences is observed. Nanoparticles are frequently used in medicine and pharmacy as delivery systems for different kinds of active substances. One of the latest develope...
Effects of Granulocyte Colony-Stimulating Factor on Opsonin Receptor Expression and Neutrophil Antibacterial Activity in a Mouse Model of Severe Acute Pancreatitis
The antimicrobial function of neutrophils, which is dependent on opsonin receptors, deteriorates in severe acute pancreatitis (SAP). Granulocyte colony-stimulating factor (G-CSF) putatively enhanced levels of the opsonin...
Histone deacetylase inhibitors – molecular mechanisms of actions and clinical applications
Histone deacetylases (HDACs) play an important role in the epigenetic regulation of gene expression implicated in cancer pathogenesis. Inhibitors of HDACs (HDI) are under investigation as novel anti-cancer drugs, which i...
Identyfikacja krążących komórek nowotworowych jako obiecująca metoda diagnostyki chorób nowotworowych układu moczowo-płciowego
Krążące komórki nowotworowe (CTCs – circulating tumour cells) definiuje się jako krążące we krwi komórki, które pod względem profilu antygenowego lub genetycznego odpowiadają charakterystyce określonego rodzaju nowotworu...