The development of pcr system for identification of beet necrotic yellow vein virus and monitoring in Ukraine

Abstract

The ELISA screening of beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) in agrocenoses of Ukraine (Western and Central Ukraine) was performed and the presence of BNYVV was shown in samples of roots of sugar beet plants selected in Chemerovetsky region of Khmelnitsky oblast. The bioinformative analysis of nucleotide sequences of isolates of BNYVV deposited in genetic databank was made. The conserved gene sequence encoding coat protein was established and specific primers for nucleotide sequences of the genome of the BNYVV were developed. The specific oligonucleotide primers were synthesized. The laboratory testing of synthesized primers and the optimization of polymerase chain reaction were made. The optimum temperature of primers hybridization was 54 °C - 62 °C and the highest production of amplicons was registered by the concentration of Mg+2 was 2,5 mM.

Authors and Affiliations

К. Гринчук, І. Антіпов, М. Єрмолаєв

Keywords

Related Articles

ДЕФІЦИТ ГЛЮКОЗИ ТА ГЛУТАМІНУ ЗМІНЮЄ ЕКСПРЕСІЮ ГЕНІВ MAP3K5, MAP4K3, CIB1, RIPK1, AND RIPK2 У КЛІТИНАХ ГЛІОМИ ЛІНІЇ U87 З ВИКЛЮЧЕНОЮ ФУНКЦІЄЮ СИГНАЛЬНОГО ЕНЗИМУ ERN1

Протеїнкінази відіграють важливу роль у рості злоякісних пухлин як ключові регулятори різноманітних метаболічних процесів. Ми вивчали ефект дефіциту глюкози та глутаміну на рівень експресії мРНК протеїнкінази кінази кіна...

Просторово-часові зміни твердості рекультоземів Нікопольського марганцево-рудного басейну

Протягом двох років досліджували просторову неоднорідність твердості дерново-літогенного ґрунту на сіро-зеленій глині ділянки рекультивації Нікопольського марганцеворудного басейну. Встановлено статистичні закономірності...

Vegetation of Biloozerska part of Rivnensky Nature Reserve

The article deals with the classification of vegetation of a protected area in northwestern Ukraine. Data on 41 vegetation plots are provided. The analysis of these relevés together with literature data allows to disting...

ВПЛИВ ОБ’ЄМНОЇ КЛІТИННОЇ СИСТЕМИ НА ДОЗРІВАННЯ РАННІХ ЕМБРІОНІВ МИШЕЙ IN VITRO

Створення умов для росту клітин на двомірних поверхнях, які б відповідали їх природним тривимірним умовам в тканинах організму, можливо використовуючи поверхні, модифіковані різними полімерами. Культивування клітин на та...

Історія досліджень рослинного світу регіонального ландшафтного парку «гадяцький» (полтавська область)

У статті наведено результати опрацювання гербарних колекцій та аналізу літературних відомостей щодо дослідження фіторізноманітності природно-заповідної території, яка охороняється у статусі регіонального ландшафтного пар...

Download PDF file
  • EP ID EP236445
  • DOI -
  • Views 88
  • Downloads 0

How To Cite

К. Гринчук, І. Антіпов, М. Єрмолаєв (2015). The development of pcr system for identification of beet necrotic yellow vein virus and monitoring in Ukraine. Naukovyi visnyk Chernivetskoho universytetu. Biolohiia (Biolohichni systemy), 7(1), 28-34. https://www.europub.co.uk/articles/-A-236445