ZNF304 gen ifadesinde artış ve CXCR4’de azalma ile prostat kanserinde anoikis değişebilir
Journal Title: Ege Tıp Dergisi - Year 2018, Vol 57, Issue 3
Abstract
Amaç: Prostat kanser hücre hattı (DU145) ve prostat normal epitel hücre hatları (RWPE) arasında anoikis mekanizmasını arttıracak veya inhibe edebilecek genlerin analizini yapmak ve kanser gelişiminde olası rolünü incelemek. Gereç ve Yöntem: İnsan prostat epitel hücre hattı (RWPE) ve prostat kanseri hücre hatları (DU-145) Amerikan Tip Kültür Koleksiyonu (ATCC)’den temin edildi. Hücre hatlarının çoğaltılmasında ve sürdürülmesinde RPMI 1640 (Biological Industries) besi ortamı kullanıldı. Transkriptom analizi için RNA izolasyonu yapılarak, kütüphane oluşturuldu, kütüphanenin kantitasyonunun ardından NextSeq500 (illumina) ile sekanslama yapıldı. Dizileme, haritalandırma, bağıl gen ifadeleri ölçümleri gibi biyoinformatik analizler Genomics Workbench v 8 (Qiagen) yazılımı kullanılarak GRCh38 referans sekansı ile yapılmıştır. Bulgular: RWPE Normal prostat epitel hücre kültürleri ile DU145 prostat kanser hücreleri karşılaştırıldığı zaman DU-145 prostat kanser hücre kültürlerinde, ZNF304, PYCARD ve Notch3 gen expresyonlarında anlamlı bir artış (p<0,05) görülürken, CXCR4, Pak3, SerpınB1 gen ekspresyonlarında anlamlı bir azalma (p<0,05) görülmüştür. Sonuç: DU145 prostat kanseri hücre hattında anoikis ile ilişkili önemli gen ekpresyonlarında artış ve azalma gözlemledik. Değişime bağlı olarak hücrelerin anoikisden kaçarak metastatik özellik kazanabileceğini düşündük.
Authors and Affiliations
Şule Ayla, Gülperi Öktem, Cüneyd Parlayan
Keywords
Related Articles
- EP ID EP460432
- DOI -
- Views 106
- Downloads 0
A rare cause of enterocutaneous fistula: Intraperitoneal mesh fold
In this report, a case of enterocutaneous fistula was presented which was developed due to the compression of folding of the adhesion barrier mesh placed intraperitoneally. After removal of the mesh, fistula was excised...
The assessment of anterior segment parameters using the Sirius topography in adults with anisohypermetropic amblyopia
Aim: To evaluate anterior segment parameters in the eyes of adults with anisohypermetropic amblyopia using the Sirius topography device. Materials and Methods: Forty-eight patients with anisohypermetropic amblyopia were...
Bilateral ovarian capillary hemangioma
Hemangiomas are benign and rare tumors of female genital tract and most of them are asymptomatic. A 52-year-old woman applied to our hospital due to postmenopausal bleeding with 7 cm diameter intramural leiomyoma of the...
Correlation of mid-trimester homocysteine, vitamin B12 and folate levels with adverse pregnancy outcomes: A clinical study
Aim: The aim of this study is to determine if maternal serum levels of folate, vitamin B12 and homocysteine at 20-26 weeks of gestation are associated with subsequent adverse pregnancy outcomes. Materials and Methods: Th...
Cardiac and cerebral involvement in Erdheim-Chester disease
Erdheim-Chester disease (ECD) is a rare non-Langerhans form of systemic histiocytosis of unknown etiology that progresses with multiple organ involvement. It is characterized by a xanthomatous infiltration showing positi...